我國(guó)構(gòu)建了人群腸道微生物菌株資源庫(kù) 探測(cè)到“暗物種”

來(lái)源:中國(guó)科學(xué)報(bào)

日,中國(guó)科學(xué)院微生物所研究員劉雙江團(tuán)隊(duì)構(gòu)建了包含400個(gè)不同物種的健康人群腸道微生物菌株資源庫(kù)(hGMB)。相關(guān)成果發(fā)表于《微生物組》。

此次構(gòu)建的hGMB包括400個(gè)不同的物種,其中有102個(gè)物種為首次分離、培養(yǎng)和鑒定,1170株代表菌株保存在中國(guó)普通微生物菌種保藏中心,已經(jīng)向科研界和產(chǎn)業(yè)界提供了數(shù)次菌株服務(wù),支持腸道微生物功能開(kāi)發(fā)和微生物—宿主互作研究。為了充分發(fā)揮和挖掘菌株資源的價(jià)值,該資源庫(kù)物種信息已在相關(guān)網(wǎng)站公布。

據(jù)介紹,hGMB的構(gòu)建歷時(shí)兩年,研究團(tuán)隊(duì)從239例來(lái)自不同地區(qū)、不同年齡體檢健康人群的新鮮糞便樣品中挑取超過(guò)2萬(wàn)個(gè)單克隆,擴(kuò)大培養(yǎng)后從中鑒定出超過(guò)1萬(wàn)個(gè)純培養(yǎng)分離株。通過(guò)對(duì)健康人腸道宏基因組分析,發(fā)現(xiàn)該菌株資源庫(kù)中的85個(gè)新物種出現(xiàn)在超過(guò)90%健康人腸道中,同時(shí)覆蓋79%人腸道已知常見(jiàn)屬和75%常見(jiàn)物種。

與目前最大的人腸道基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(UHGG)對(duì)比,hGMB貢獻(xiàn)了24個(gè)在腸道免培養(yǎng)組學(xué)研究中未被探測(cè)到卻普遍存在的“暗物種”。

作者表示,鑒于腸道微生物菌株資源庫(kù)的建設(shè)是開(kāi)發(fā)利用腸道微生物的基礎(chǔ),是認(rèn)知宿主—微生物互作機(jī)制中至關(guān)重要的一環(huán),構(gòu)建中華腸道微生物資源庫(kù)具有長(zhǎng)遠(yuǎn)的戰(zhàn)略意義和經(jīng)濟(jì)社會(huì)價(jià)值。

去年,該團(tuán)隊(duì)還發(fā)表了迄今為止最大的模式動(dòng)物小鼠腸道微生物資源庫(kù)(mGMB),包含126種微生物及其基因組,其中77種微生物是首次成功分離培養(yǎng)的新物種,使得可培養(yǎng)的小鼠腸道微生物菌株資源從48個(gè)屬增加到110個(gè)屬、從76種增加到180種,且在此過(guò)程中形成了一套厭氧微生物分離培養(yǎng)與物種鑒定描述的標(biāo)準(zhǔn)化流程。

標(biāo)簽: 我國(guó) 人群腸道 微生物 菌株 資源庫(kù) 暗物種

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